Fakultas Seni Media Rekam (FSMR) ISI Yogyakarta mempunyai 1 Koordinator dan 4 (empat) Sub Koordinator Bagian yaitu :
Koordinator Tata Usaha
- Sub Koordinator Akademik
- Sub Koordinator Kemahasiswaan
- Sub Koordinator Keuangan dan Kepegawaian
- Sub Koordinator Umum dan Perlengkapan